2009年12月31日

発散回、先祖の人口は有効な大きさ

DNA断片のシーケンスを、以前の種よりも分かれている。先祖伝来の人口の大規模な効果的な人口の大きさ(左)は、DNAのセグメント時間の長い期間(=遺伝子)のさまざまな変種を保持します。したがって、平均では、遺伝子の相違回(チDNA断片は、結核のDNAセグメントB)の種()はTS発散の時から小さな先祖の効果的な人口の大きさ(右)に比べてより逸脱されます。

現行の方法で発散度を判断するためにDNA配列アライメントと分子時計を使用します。通常は、分子時計を想定校正されている(人間を含むアフリカの類人猿からオランウータンの分割)12月16日マイア。いくつかの研究にもいくつかの旧世界のサルを含めると25-30マイアにhominoidsからそれらの発散の時間を設定します。両方の校正ポイントを、非常に小さな化石のデータに基づいており、批判されている。[4]の場合、これらの日付に改訂され、発散回分子データから推定したとしても変更されます。しかし、相対的な発散時間は変更する可能性は低い。もし正確に絶対的な相違回言うことができないとしても、我々はとても、チンパンジーと人間との間の乖離時間は約6倍(または人間がチンパンジーとの間よりも短くなっています)を確認することができますサル。

1つの研究(高畑他、1995年)からは、ゲノムのさまざまな地域から人間とチンパンジーと人間のチンパンジーとゴリラから7のDNA配列[5]彼らは、チンパンジーより密接にゴリラよりもヒトに関連して決定15のDNA配列を使用。様々な統計的手法を使用して、彼らは4.7マイアやゴリラと人間の(とチンパンジーの間の乖離時間)、7.2マイアにする発散時間人間がチンパンジーと推定。また、彼らする〜100,000、人間とチンパンジーの共通の祖先を効果的に人口のサイズを推定した。これはやや意外な人間のため、現在の1日効果的な人口の大きさだったの推定のみ〜10,000することです。 trueの場合は、そのヒトの祖先は、効果的な人口規模はその進化の過程で(つまり遺伝的多様性)の広大な減少を経験したことを意味します。 ()鳥羽破局の理論を参照して
AとBの2つの異なる遺伝子座です。彼らは種のツリーに収まるように、上の図では。 DNAは、今日のゴリラに存在する場合、以前のDNAは、今日の人間とチンパンジーに存在しているからそれた。このように両方の遺伝子座の間に似ている必要があります人間やゴリラ、チンパンジーやゴリラと人間の間よりもチンパンジー。下のグラフでは、人間やゴリラ、チンパンジーのシーケンスと比較してより最近の共通の祖先が軌跡。一方、チンパンジーとゴリラの遺伝子座Bの最近の共通の祖先をここでは、遺伝子の樹木種のツリーに不適合れている。

(陳&李、2001)、人間、チンパンジー、ゴリラとオランウータン[1]時のDNA配列を1つの長いシーケンスに連結されたから53、非反復的、遺伝子間のDNA断片配列別の研究では、生成された近隣ツリーに参加するホモパンクレード100%のブートストラップでサポートされ(つまり、人間とチンパンジーは4つの最も近い近縁種です)です。ときに、3種はかなり密接にそれぞれ(のような人間は、他の)にチンパンジーとゴリラ関連して、木々のDNA塩基配列データからは、分化(種のツリーを表します)は、ツリーと合同することはできませんを取得しました。短い節間の時間のスパン(1206)は、より一般的な不適合の遺伝子植えられている。ノード間の人口の効果的な人口の大きさ(ネ)どのくらいの遺伝的系統の人口に保存されて決定されます。より効果的な人口規模以上不適合遺伝子の木になります。場合は、ノード間の時間スパン知られているため、ヒトとチンパンジーの共通の祖先の祖先の効果的な人口のサイズを計算することができます。

ときに、各セグメントを個別に分析したが、31日にホモゴリラクレードサポートされて、ホモパンクレード、10を支持し、12サポートされてパンゴリラクレード。著者は、ゴリラの最初の6.2から8.4マイアとチンパンジーと人間の分割と推定分子時計を使用して最大1.6〜2200000年後(ノード間の時間スパン)4.6から6.2マイアを分割します。節間のタイムスパン、人間とチンパンジーの共通の祖先の祖先の効果的な人口規模を推定するのに便利です。

けちな分析は、24座ホモゴリラクレード2サポートされてパンゴリラクレードをサポートする20のホモパンクレード、7サポートされていない解像度を与えた明らかにした。また、35人のタンパク質のデータベースからの遺伝子座のコーディングした。これらの12の解決策を与えたホモパンクレード、3ホモゴリラクレード、4は、Pan -ゴリラクレードおよび16を支持した。したがって〜だけでは解決した52座の70%(33、19タンパク質コーディング)'正しい種ツリーをサポートして遺伝子間。遺伝子座は、彼らは、以前と推定節間の時間のスパンは、種のツリーをサポートしていない部分から、人間とチンパンジーの共通の祖先を効果的に人口が〜52 000から96 000推定された。この値としては最初の調査(高畑)から、まだ多く今日よりも、人間の効果的な人口サイズの高されていません。怪しげな - 議論]

3番目の研究(ヤン、2002)は、同じデータセットには、陳、李使用されるが、'の先祖の効果的な人口'のみ〜12,000〜21,000推定値を使用して使用される
posted by cococo at 17:11| 日記 | このブログの読者になる | 更新情報をチェックする




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